Net als ramen worden ook zonnepanelen op den duur vuil. Hoewel het oppervlak van zonnepaneelglas minder snel vuil vasthoudt vanwege speciale behandelingen in de fabriek, zal het glas na verloop van tijd echter toch vuil vasthouden: vuil, defecte cellen en kapotte diodes. Al deze zaken kunnen uw rendement negatief beïnvloeden. Om het maximale uit uw kostbare investering te halen, dient u uw zonnepaneleninstallatie goed te onderhouden.
Over zonnepanelen wordt ook wel gezegd dat ze zelfreinigend zouden zijn of door regenwater volledig schoongespoeld worden. Dit is niet helemaal juist. Al houdt het oppervlak van zonnepaneelglas dan minder snel vuil vast, er blijft altijd hardnekkig vuil achter. Een ernstig probleem dat door vervuiling kan ontstaan bij zonnepanelen zonder bypass diodes zijn ‘hotspots’. Hierbij stroomt de stroom niet door de zonnecel en wordt door weerstand omgezet in warmte. De cel wordt lokaal te warm met donkere brandvlekken tot gevolg.